国际植物保护公约秘书处对下一代测序技术(NGS)在植物病虫害物诊断上的应用发表意见

Posted on 星期三, 29 十一月 2017, 10:47

2017年11月22日至23日,关于使用下一代测序技术(NGS)进行植物病虫害诊断(也称为高通量测序)的研讨会在意大利巴里举行。该研讨会由欧洲科学技术合作组织(COST)、EUPHRESCO以及欧洲和地中海植物保护组织(EPPO)组织,并得到了意大利国家植物保护协会的支持。 NGS是一种检测和鉴定生物体的非常有力的替代方法。来自世界各地的超过142位参与者聚集在一起,分享和讨论他们关于使用这些技术发现有害生物的经验。也有人表示担忧,有些情况下检测和鉴定可能仅仅与DNA检测相关,并不是来自活虫或病原体,这是风险所在。与会者进行了一次头脑风暴,就使用下代测序技术作为植物病虫害诊断工具提出建议或“最佳做法”。

Adriana G. Moreira女士代表国际植物保护公约强调,正确解读NGS的结果是植物检疫方面最大的挑战之一。她指出,正当的病虫害诊断是执行许多标准的基础,正确使用NGS技术和正确解读结果是至关重要的。她解释说,负责管理和改进国际植物保护公约诊断规程(“国际植检措施标准第27号——限定有害生物诊断规程附件)的诊断规程技术小组(TPDP)讨论了使用NGS作为植物检疫的诊断工具,她们注意到,并不是所有与植物有关的有机体都是有害生物,有些可能为寄主植物或共生媒介提供了好处。因此,这些技术目前可用于筛选货物,但不构成最终决定的基础(例如对货物的销毁或退运)。

IPPC标准委员会(SC)注意到诊断规程技术小组关于NGS的建议,并强调这个问题比仅讨论诊断要广泛 - 它也与有害生物风险分析和监测也有关,建议NGS技术还需要进一步的工作,才能被视为唯一的有害生物检测方法。2018年召开的植物检疫措施委员会第13届会议(CPM-13)将举行一个“基因测序和分子技术”方面的分组会,讨论植物检疫背景下的NGS技术。

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