Новый пересмотренный текст МККЗР был утвержден в 1997 году. Пересмотр текста был необходим для того, чтобы отразить в нем современные фитосанитарные концепции и роль МККЗР в отношении Уругвайского раунда переговоров Всемирной торговой организации и, в частности, Соглашения по применению санитарных и фитосанитарных мер (Соглашение по СФС).
В Соглашении по СФС МККЗР определяется в качестве организации, устанавливающей международные стандарты для мер, принимаемых правительствами в целях защиты растительных ресурсов от вредных организмов (фитосанитарные меры; обеспечивая в то же время техническую обоснованность фитосанитарных мер, которые не должны использоваться в качестве неоправданных барьеров в международной торговле.
Положения МККЗР хотя и оказывают значительное воздействие на международную торговлю, в центре ее внимания тем не менее находится международное сотрудничество в целях защиты растений. Многие виды сотрудничества подпадают под сферу действия Конвенции. Применение Конвенции не ограничивается защитой культивируемых растений или прямым вредом, наносимым вредными организмами. Конвенция также охватывает защиту культивируемых и дикорастущих растений и растительных продуктов и включает как прямой, так и косвенный ущерб, наносимый вредными организмами.
Новый пересмотренный текст МККЗР (1997 год) делает особый упор на сотрудничестве и обмене информацией с целью глобальной гармонизации мер. Помимо описания обязательств стран в области защиты растений в тексте также затронуты важные элементы международного сотрудничества в области охраны здоровья растений и процесса установления и применения Международных стандартов по фитосанитарным мерам (МСФМ).
Основной задачей при пересмотре текста Конвенции являлось обеспечение более эффективного осуществления Конвенции. Для этих целей ФАО в Службе защиты растений Отдела растениеводства и защиты растений Департамента сельского хозяйства был создан Секретариат МККЗР. Программа работы Секретариата МККЗР в основном состоит из трех видов деятельности: